[caret-users] multiple comparison correction on SUMA data

John Harwell john at brainvis.wustl.edu
Mon Nov 16 16:11:49 CST 2009




On Nov 16, 2009, at 5:27 AM, Oers, C.A.M. van wrote:

> Hi,
>
> Although I saw a post by Donna Dierker regarding the subject, I am  
> afraid I still have a question.
>
> I have created SUMA files using a mixed model analysis. The  
> resulting files have an individual statistical threshold (and  
> coefficient). I would like to use Caret to do a multiple comparison  
> correction with a cluster size threshold.
>
> How can I convert a 1D surface file into a metric or surface_shape  
> file?
> Which way to perform the correction?
>

SUMA may be able to write its files in GIFTI (www.nitrc.org/projects/gifti 
) format which Caret is able to read and write.  Check with the AFNI/ 
SUMA team on how to convert a 1D file to GIFTI.

John

> I appreciate the help,
> Casper
> De informatie opgenomen in dit bericht kan vertrouwelijk zijn en is  
> uitsluitend bestemd voor de geadresseerde. Indien u dit bericht  
> onterecht ontvangt, wordt u verzocht de inhoud niet te gebruiken en  
> de afzender direct te informeren door het bericht te retourneren.  
> Het Universitair Medisch Centrum Utrecht is een publiekrechtelijke  
> rechtspersoon in de zin van de W.H.W. (Wet Hoger Onderwijs en  
> Wetenschappelijk Onderzoek) en staat geregistreerd bij de Kamer van  
> Koophandel voor Midden-Nederland onder nr. 30244197.
>
> Denk s.v.p aan het milieu voor u deze e-mail afdrukt.
>
> This message may contain confidential information and is intended  
> exclusively for the addressee. If you receive this message  
> unintentionally, please do not use the contents but notify the  
> sender immediately by return e-mail. University Medical Center  
> Utrecht is a legal person by public law and is registered at the  
> Chamber of Commerce for Midden-Nederland under no. 30244197.
>
> Please consider the environment before printing this e-mail.
>
> _______________________________________________
> caret-users mailing list
> caret-users at brainvis.wustl.edu
> http://brainvis.wustl.edu/mailman/listinfo/caret-users




More information about the caret-users mailing list